Theo phê duyệt, tổng diện tích quy hoạch là 977,568 ha gồm: Khu vực bảo vệ của di tích, có diện tích là 499,818 ha; khu vực mở rộng phát huy giá trị di tích có diện tích 477,750 ha. Phạm vi quy hoạch bao gồm phần đất thuộc địa phận xã Thành Yên và xã Thành Minh.
Cụ thể, phần đất thuộc địa phận xã Thành Yên, có diện tích 776,098 ha; phần đất thuộc địa phận xã Thành Minh có diện tích 201,470 ha.
Mục tiêu của Quy hoạch nhằm bảo tồn, tôn tạo và phát huy giá trị di tích khảo cổ hang Con Moong và các di tích phụ cận với các minh chứng xác thực cho diễn tiến văn hóa của người Việt cổ.
Không gian bảo tồn, tôn tạo đối với từng điểm di tích được quy hoạch trên cơ sở bảo đảm tôn trọng tối đa tính nguyên gốc về các giá trị văn hóa, lịch sử của khu vực di tích; tái hiện tính đặc trưng của di tích là hang động gắn với rừng nguyên sinh bao quanh và suối; bảo vệ đa dạng sinh học và hệ sinh thái rừng đặc dụng của Vườn quốc gia Cúc Phương; bảo quản các hố khai quật khảo cổ hiện có.
Quy hoạch cũng nêu rõ, thực hiện thám sát và khai quật bổ sung trước khi triển khai hoạt động xây dựng các công trình phát huy giá trị di tích có nguy cơ ảnh hưởng đến khu vực có thể có các di chỉ. Quy hoạch bảo tồn, tôn tạo các điểm di tích (bao gồm: Hang Con Moong, hang Lai, hang Diêm, hang Lý Chùn, hang Bố Giáo, thành đất đắp núi Đầu Voi và hang và mái đá Mộc Long).
Quy hoạch phát triển không gian các khu phát huy giá trị di tích theo nguyên tắc bố cục không gian tự do, đường nét quy hoạch tự nhiên; hình thức kiến trúc của các công trình xây dựng mới bảo đảm hài hòa với không gian cảnh quan bản địa và di tích hang động…
