Việc tổ chức thi công được thực hiện theo phương án phân luồng giao thông chi tiết nhằm hạn chế tối đa ảnh hưởng đến việc đi lại của người dân.
Theo thông báo của Sở Xây dựng Hà Nội, dự án triển khai hạng mục xây dựng các tuyến cống thoát nước mới dọc đường Nguyễn Trãi với tổng chiều dài khoảng 1.220m. Các tuyến cống có kích thước từ BxH=(1,5x1,25)m đến (2,5x2,25)m, nhằm tăng khả năng tiêu thoát nước, góp phần giải quyết tình trạng úng ngập cục bộ tại khu vực này.
Để phục vụ thi công, tuyến đường Nguyễn Trãi sẽ được tổ chức rào chắn và phân luồng giao thông theo từng đoạn. Cụ thể, đoạn từ khu vực Royal City đến nút giao Nguyễn Trãi-Vũ Trọng Phụng (dài khoảng 792m) sẽ được rào chắn cố định bằng rào tôn kết hợp lưới B40 theo từng phân đoạn dài từ 20-30m. Phần đào đường rộng khoảng 4,6m, bề rộng rào chắn khoảng 5,6m. Sau khi hoàn thành từng phân đoạn, đơn vị thi công sẽ hoàn trả mặt đường trước khi tiếp tục triển khai đoạn tiếp theo nhằm bảo đảm an toàn giao thông.
Trong phạm vi thi công, bề rộng mặt đường còn lại trung bình từ 5-12m mỗi bên rào chắn để các phương tiện lưu thông cục bộ theo hướng từ Ngã Tư Sở đi Vành đai 3. Tại các vị trí đào qua khu vực điểm mở dải phân cách giữa, các phương tiện từ các tuyến đường nhánh trong phạm vi 50m sẽ không được quay đầu trực tiếp mà phải di chuyển đến điểm quay đầu kế tiếp theo hướng dẫn của lực lượng chức năng.
Đối với đoạn từ nút giao Nguyễn Trãi-Vũ Trọng Phụng đến cầu bộ hành trước Trường đại học Khoa học Xã hội và Nhân văn (dài khoảng 317m), việc thi công được tổ chức theo hình thức rào chắn di động, cuốn chiếu từng đoạn dài khoảng 10m. Các hoạt động thi công tại khu vực này chủ yếu diễn ra vào ban đêm, từ 22 giờ đến 5 giờ sáng hôm sau để giảm thiểu ảnh hưởng đến lưu lượng giao thông giờ cao điểm.
Tương tự, đoạn từ cầu bộ hành trước Trường đại học Khoa học Xã hội và Nhân văn đến nút giao Nguyễn Trãi-Nguyễn Tuân (dài khoảng 149m) cũng được thi công cuốn chiếu vào ban đêm, với phạm vi đào đường rộng khoảng 2m và rào chắn rộng khoảng 3m. Sau mỗi ca thi công, mặt đường sẽ được hoàn trả tạm thời để bảo đảm an toàn cho các phương tiện lưu thông.
Trong suốt thời gian thi công, hệ thống biển báo, đèn cảnh báo ban đêm và các thiết bị bảo đảm an toàn giao thông sẽ được lắp đặt đầy đủ theo quy định. Đồng thời, các đơn vị liên quan bố trí lực lượng hướng dẫn, phân luồng giao thông 24/24 giờ tại khu vực thi công nhằm hạn chế ùn tắc và bảo đảm trật tự an toàn giao thông.
Sở Xây dựng Hà Nội cũng đề nghị Phòng Cảnh sát giao thông - Công an thành phố phối hợp điều tiết giao thông từ xa trên các tuyến Nguyễn Trãi, Cự Lộc, Chính Kinh, Vũ Trọng Phụng và Nguyễn Tuân, đặc biệt tại các nút giao lớn để giảm áp lực giao thông trong thời gian triển khai dự án.
Dự án xây dựng hệ thống cống thoát nước mới trên đường Nguyễn Trãi là một trong những hạng mục thuộc chương trình đầu tư xây dựng chống úng ngập cục bộ cho khu vực nội đô Hà Nội. Khi hoàn thành, công trình được kỳ vọng sẽ nâng cao năng lực tiêu thoát nước, góp phần cải thiện hạ tầng đô thị và giảm tình trạng ngập úng tại một trong những tuyến giao thông huyết mạch của Thủ đô.