Công trình được quy hoạch hài hòa trong quần thể ddi tích lịch sử - văn hóa - sinh thái núi Chung, gồm nhiều hạng mục kiến trúc truyền thống, vừa trang nghiêm, vừa gần gũi với cảnh quan làng Sen quê Bác.
Trong chính điện, ban thờ cụ Phó bảng Nguyễn Sinh Sắc, cụ Hoàng Thị Loan cùng các anh chị em ruột của Bác được bài trí trang nghiêm. Người đến dâng hương không chỉ tưởng nhớ vị lãnh tụ vĩ đại mà còn thành kính trước tổ tiên, những bậc sinh thành đã nuôi dưỡng nên một người con ưu tú của đất nước, đã dành trọn cuộc đời hồi sinh dân tộc. Chính ý nghĩa ấy đã khiến ngôi đền trở thành điểm đến không thể thiếu trong hành trình về nguồn của nhiều người. Nơi đây thường xuyên đón các đoàn cán bộ, học sinh, sinh viên, cựu chiến binh và du khách bốn phương đến dâng hương, tìm hiểu lịch sử, kết nối với các điểm di tích như quê nội, quê ngoại của Bác, mộ cụ Hoàng Thị Loan và các di tích ở Kim Liên.
Nhiều năm nay, cứ mỗi dịp tháng 7, cựu chiến binh Lê Thị Khang (Hà Nội) lại tổ chức những chuyến hành hương về nguồn cho đồng đội, người thân cùng dâng hương tại đền Chung Sơn rồi tiếp tục đến các nghĩa trang liệt sĩ trên địa bàn miền trung. Theo bà, hành trình ấy không chỉ để tưởng nhớ những người đã khuất mà còn là dịp giáo dục thế hệ trẻ về lòng biết ơn.
Còn nhà văn Lê Đức Nghinh, người nhiều lần trở lại Kim Liên, cho rằng đền Chung Sơn mang một giá trị văn hóa rất riêng. "Người Việt vốn coi trọng chữ hiếu. Đền Chung Sơn không chỉ kể câu chuyện về gia đình Chủ tịch Hồ Chí Minh mà còn nhắc chúng ta giá trị của nguồn cội. Một dân tộc biết tri ân những thế hệ tiền nhân, các bậc hiền tài thì dân tộc ấy sẽ luôn giữ được nền tảng đạo đức. Tôi nghĩ đây không đơn thuần là một điểm du lịch tâm linh mà là một không gian giáo dục văn hóa và nhân cách rất sâu sắc”.
Có lẽ cũng bởi ý nghĩa ấy, đền Chung Sơn không tạo cảm giác choáng ngợp bởi quy mô hay sự cầu kỳ của kiến trúc. Điều lưu lại trong lòng người sau mỗi chuyến viếng thăm là sự bình yên, vững tâm nơi nguồn cội.
