Đây là nội dung trọng tâm của Thông tư số 29/2025/TT-BTC do Bộ Tài chính ban hành ngày 26/5/2025, sửa đổi, bổ sung Thông tư số 191/2015/TT-BTC về thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh gửi qua chuyển phát nhanh quốc tế.
Việc ban hành Thông tư 29 nhằm cập nhật quy định, bảo đảm triển khai hiệu quả chính sách thuế mới và thực hiện hóa mục tiêu chuyển đổi số trong lĩnh vực hải quan.
Trước đây, theo Quyết định số 78/2010/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ, hàng hóa nhập khẩu có giá trị từ 1 triệu đồng trở xuống được miễn cả thuế nhập khẩu và thuế giá trị gia tăng. Tuy nhiên, chính sách này đã chính thức bị bãi bỏ từ ngày 18/2/2025 theo Quyết định số 01/2025/QĐ-TTg, nhằm bảo đảm cơ sở pháp lý để cơ quan thuế thực hiện nghĩa vụ thu thuế đối với hàng hóa bán từ các sàn thương mại điện tử nước ngoài vào Việt Nam.
Từ thời điểm đó, hàng hóa trị giá thấp nhập khẩu qua dịch vụ chuyển phát nhanh chỉ còn được miễn thuế nhập khẩu theo quy định tại khoản 2 Điều 29 Nghị định 134/2016/NĐ-CP (được sửa đổi tại Nghị định 18/2021/NĐ-CP), nhưng vẫn phải nộp thuế giá trị gia tăng theo quy định của Luật Thuế giá trị gia tăng .
Trong giai đoạn chuyển tiếp, do chưa có quy định và chức năng hệ thống phù hợp, cơ quan hải quan buộc phải tổ chức thu thuế giá trị gia tăng bằng phương thức thủ công. Điều này không chỉ khiến doanh nghiệp gặp khó khăn khi thực hiện thủ tục, mà còn tạo áp lực lớn lên lực lượng hải quan tại các chi cục, tiềm ẩn nguy cơ sai sót, thất thu ngân sách và làm chậm thời gian thông quan.
Thông tư 29/2025/TT-BTC được ban hành theo thủ tục rút gọn để kịp thời bổ sung các quy định cần thiết, bảo đảm tính pháp lý và kỹ thuật cho việc thu thuế giá trị gia tăng tự động qua hệ thống. Thông tư cũng kế thừa một số nội dung từ Thông tư 56/2019/TT-BTC và đồng bộ với yêu cầu triển khai hệ thống phân luồng, xử lý hồ sơ tự động.
Theo kế hoạch, Cục Hải quan sẽ triển khai thí điểm hệ thống từ ngày 9 đến 31/7/2025 tại một số doanh nghiệp chuyển phát nhanh. Từ ngày 1/8/2025, hệ thống sẽ áp dụng chính thức với tất cả doanh nghiệp thực hiện chuyển phát nhanh quốc tế, bao gồm cả đường hàng không, đường bộ và đường sắt.
Ngày 10/7, Phó Cục trưởng Cục Hải quan Trần Đức Hùng đã trực tiếp kiểm tra, chỉ đạo công tác chuẩn bị tại Chi cục Hải quan khu vực II – đơn vị phụ trách lĩnh vực chuyển phát nhanh, nhằm đảm bảo triển khai đồng bộ, hiệu quả và hạn chế phát sinh vướng mắc trong quá trình thực hiện.
Việc triển khai thu thuế giá trị gia tăng tự động không chỉ bảo đảm thu đúng, thu đủ cho ngân sách nhà nước mà còn thúc đẩy cải cách hành chính, hiện đại hóa ngành hải quan, giảm thời gian thông quan, tạo thuận lợi thương mại cho doanh nghiệp.
Theo đánh giá của Bộ Tài chính, Thông tư 29/2025/TT-BTC sẽ góp phần quan trọng vào việc phòng ngừa gian lận thuế, bảo đảm công bằng trong nghĩa vụ thuế giữa doanh nghiệp trong nước và nhà cung cấp nước ngoài, đồng thời thúc đẩy sự phát triển lành mạnh của thương mại điện tử xuyên biên giới – lĩnh vực đang tăng trưởng nhanh tại Việt Nam.
Thông tư có hiệu lực từ ngày 9/7/2025 và là cơ sở pháp lý quan trọng để vận hành hệ thống thu thuế giá trị gia tăng tự động từ ngày 1/8/2025.
