Theo kết quả điều tra ban đầu: Trung tâm Y tế thị xã Nghi Sơn có chức năng thực hiện các hoạt động phòng, chống dịch, bệnh truyền nhiễm (trong đó có nhiệm vụ lấy mẫu, thu tiền xét nghiệm Covid-19 để gửi đến các trung tâm có chức năng xét nghiệm). Từ ngày 21/8 đến ngày 15/10/2021, với vai trò là Giám đốc Trung tâm Y tế thị xã Nghi Sơn, Nguyễn Văn Thiệp chỉ đạo nhân viên và một số người ngoài trung tâm thực hiện lấy mẫu đơn của các đối tượng bắt buộc (có thu phí), thu tiền xét nghiệm PCR với giá 720 nghìn đồng/mẫu. Sau lấy mẫu, ông Thiệp chỉ đạo chuyển mẫu đến Công ty Cổ phần nghiên cứu khoa học xét nghiệm công nghệ cao Hợp Lực, thực hiện xét nghiệm theo mẫu gộp mẫu 5 (nếu còn dư thì xét nghiệm theo số dư).
Quá trình điều tra, Nguyễn Văn Thiệp khai nhận thực hiện hành vi trên với mục đích tạo thêm việc làm, thu nhập cho bản thân và những người liên quan. Lời khai của Nguyễn Văn Thiệp phù hợp với lời khai của những người liên quan, các tài liệu chứng cứ cơ quan điều tra thu thập.
Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Thanh Hóa tiếp tục điều tra, làm rõ vụ án. Đề nghị các bị hại là những người đã lấy mẫu xét nghiệm PCR trong thời gian từ 15/8 đến 16/10/2021, chưa được làm việc với Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Thanh Hóa và Cơ quan cơ quan Cảnh sát điều tra Công an thị xã Nghi Sơn thì liên hệ với Phòng Cảnh sát kinh tế Công an tỉnh Thanh Hóa phục vụ công tác điều tra vụ án.
