Cuộc tổng điều tra được thực hiện theo phương pháp điều tra toàn bộ kết hợp với điều tra chọn mẫu. Trong thời gian một tháng, cơ quan thống kê sẽ điều tra tất cả các đơn vị tham gia hoạt động nông nghiệp, lâm nghiệp, thủy sản bao gồm các hộ, trang trại, doanh nghiệp, hợp tác xã, Ủy ban nhân dân các xã; các đơn vị tham gia hoạt động nông nghiệp, lâm nghiệp, thủy sản thuộc quản lý của Bộ Quốc phòng.
Cơ quan thống kê sẽ tiến hành điều tra chọn mẫu đối với hộ tham gia hoạt động nông nghiệp, lâm nghiệp, thủy sản để thu thập một số thông tin chuyên sâu, bổ sung các thông tin của hộ, phục vụ nghiên cứu hoạt động sản xuất của hộ.
Đây là một trong 3 cuộc tổng điều tra thống kê quốc gia có quy mô lớn, ý nghĩa hết sức quan trọng trong việc cung cấp thông tin đầy đủ, toàn diện về thực trạng phát triển nông nghiệp, nông thôn và đời sống của người dân nông thôn trên phạm vi cả nước; là lần tổng điều tra thứ 6 kể từ năm 1994, được tổ chức trong bối cảnh Việt Nam đang đẩy mạnh chuyển đổi xanh, phát triển nông nghiệp bền vững và thực hiện các cam kết quốc tế về phát triển nông thôn, giảm nghèo và biến đổi khí hậu.
