Theo đó, Thành phố đề xuất hợp nhất Sở Xây dựng và Sở Giao thông Công chánh thành Sở Xây dựng; tách chức năng quản lý nhà nước về quy hoạch xây dựng và kiến trúc từ Sở Xây dựng để thành lập Sở Quy hoạch - Kiến trúc; đổi tên Sở Tài nguyên và Môi trường thành Sở Nông nghiệp và Môi trường.
Cùng với đó, Thành phố cũng đề xuất hợp nhất Ban Quản lý Khu Công nghệ cao với Ban Quản lý Khu Nông nghiệp Công nghệ cao thành một đơn vị chung; giải thể Ban Quản lý Đầu tư Xây dựng Khu đô thị Nam Thành phố.
Đặc biệt, xem xét sáp nhập Ủy ban về Người Việt Nam ở nước ngoài vào Văn phòng UBND Thành phố.
Hiện, UBND Thành phố đã trình Thủ tướng Chính phủ và Bộ Nội vụ phương án này, đồng thời tiến hành lấy ý kiến các bộ, ngành liên quan trước khi Chính phủ quyết định.
