Tại bảng A, cả hai cặp đấu cuối cùng giữa U13 Becamex Bình Dương gặp U13 SLNA và U13 Bình Dương gặp U13 PVF đều khép lại với tỷ số hoà 0-0. Kết quả này giúp U13 Sông Lam Nghệ An giành ngôi nhất bảng với 7 điểm, trong khi U13 PVF đi tiếp với tư cách nhì bảng (4 điểm).
Ở bảng B, U13 SHB Đà Nẵng tiếp tục phong độ ổn định khi vượt qua U13 VES Bà Rịa-Vũng Tàu với tỷ số 2-0, qua đó kết thúc vòng bảng với ngôi đầu (7 điểm). Suất nhì bảng thuộc về U13 Haduwaco Hải Dương (4 điểm) sau chiến thắng đậm 3-0 trước U13 Huế.
Bảng C chứng kiến màn lội ngược dòng ấn tượng của U13 Nam Định trước U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh với tỷ số 2-1, qua đó giành ngôi đầu với 7 điểm. Dù thất bại, U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh vẫn đi tiếp với vị trí nhì bảng (6 điểm). Trong khi đó, U13 Quảng Nam đành dừng bước đáng tiếc dù thắng đậm 8-0 trước U13 Navy Phú Nhuận ở lượt cuối, nhưng chỉ cán đích ở vị trí thứ ba (4 điểm).
Tại bảng D, U13 LP Bank Hoàng Anh Gia Lai thể hiện sức mạnh khi thắng U13 Hà Nội 2-1 để giữ vững ngôi đầu bảng (7 điểm). Bất ngờ lớn nhất thuộc về U13 Thành phố Hồ Chí Minh khi giành chiến thắng 1-0 trước U13 Phú Thọ để kết thúc vòng bảng với 5 điểm và suất nhì bảng xứng đáng.
Với kết quả này, 4 cặp đấu tứ kết đã được xác định:
- Tứ kết 1: U13 Sông Lam Nghệ An gặp U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh
- Tứ kết 2: U13 SHB Đà Nẵng gặp U13 Thành phố Hồ Chí Minh
- Tứ kết 3: U13 Nam Định gặp U13 PVF
- Tứ kết 4: U13 LP Bank Hoàng Anh Gia Lai gặp U13 Haduwaco Hải Dương
