Tại bảng A, câu lạc bộ Thể Công Viettel vượt qua Huế với tỷ số 2-1 để giữ vững ngôi đầu với 19 điểm. Trận hòa 1-1 giữa câu lạc bộ Công an Hà Nội và Hà Nội giúp đội bóng Thủ đô giành vị trí nhì bảng với 14 điểm, trong khi Công an Hà Nội xếp thứ ba với 12 điểm.
Bảng B chứng kiến phong độ ổn định của PVF–Công an nhân dân, khi đội bóng này hòa Thép Xanh Nam Định 0-0 để kết thúc vòng loại với 24 điểm, đứng đầu bảng một cách thuyết phục.
Sông Lam Nghệ An đánh bại Hải Phòng 1-0 để giành ngôi nhì với 21 điểm. Trong khi đó, Đông Á Thanh Hóa có chiến thắng đậm 8-2 trước Luxury Hạ Long, khép lại vòng loại trong thế không còn khả năng đi tiếp.
Tại bảng C, câu lạc bộ Thành phố Hồ Chí Minh tạo dấu ấn bằng chiến thắng 4-2 trước SHB Đà Nẵng. Trong khi đó, trận hòa 3-3 giữa Gia Lai và LPBank Hoàng Anh Gia Lai giúp LPBank Hoàng Anh Gia Lai giành ngôi nhất bảng với 15 điểm. SHB Đà Nẵng xếp thứ nhì với 13 điểm, còn Thành phố Hồ Chí Minh đứng thứ ba với 12 điểm.
Bảng D là nơi chứng kiến sự vượt trội của câu lạc bộ Bóng đá Thành phố Hồ Chí Minh khi đánh bại Đồng Nai 4-1, khép lại vòng loại với 22 điểm và vị trí nhất bảng. An Giang giành vé nhì bảng với 17 điểm sau trận hòa 1-1 trước Vĩnh Long. Ở trận đấu còn lại, Becamex Thành phố Hồ Chí Minh đánh bại Tây Ninh 2-1 để cán đích ở vị trí thứ ba với 14 điểm.
Như vậy, 8 tấm vé trực tiếp vào Vòng chung kết thuộc về các đội nhất và nhì của 4 bảng gồm: Thể Công Viettel (nhất bảng A), Hà Nội (nhì bảng A), PVF–Công an nhân dân (nhất bảng B), Sông Lam Nghệ An (nhì bảng B), LPBank Hoàng Anh Gia Lai (nhất bảng C), SHB Đà Nẵng (nhì bảng C), câu lạc bộ Bóng đá Thành phố Hồ Chí Minh (nhất bảng D và cũng là chủ nhà), An Giang (nhì bảng D).
Bốn suất còn lại được xác định cho ba đội xếp thứ ba có thành tích tốt nhất, gồm Công an Hà Nội (bảng A), Thép Xanh Nam Định (bảng B) và Thành phố Hồ Chí Minh (bảng C). Do câu lạc bộ Bóng đá Thành phố Hồ Chí Minh đã có vé vào vòng chung kết bằng thành tích chuyên môn, suất đặc cách dành cho đội chủ nhà được chuyển giao cho Becamex Thành phố Hồ Chí Minh – đội xếp thứ ba bảng D.
Vòng chung kết Giải bóng đá vô địch U17 quốc gia – Cúp Thái Sơn Nam năm 2025 hứa hẹn sẽ là sân chơi chất lượng, nơi các cầu thủ trẻ xuất sắc nhất cả nước hội tụ, tranh tài, cống hiến những màn trình diễn hấp dẫn, góp phần khẳng định tiềm năng và chiều sâu của công tác đào tạo bóng đá trẻ tại các câu lạc bộ và trung tâm bóng đá trên cả nước.
