Theo đó, việc điều chỉnh phương án nhằm mục tiêu bảo vệ được sự nguyên vẹn diện tích rừng tự nhiên hiện có là hơn 60 nghìn ha và diện tích khoanh nuôi, trồng mới tăng thêm hằng năm để tiếp tục duy trì ổn định độ che phủ rừng của Khu Bảo tồn đến năm 2030 từ 96,9% trở lên; nâng cao giá trị phòng hộ đầu nguồn cho sông suối, hồ đập thủy điện trong vùng, góp phần bảo vệ môi trường sinh thái khu vực.
Bảo vệ được số lượng quần thể, cá thể các loài động, thực vật rừng đặc hữu, nguy cấp, quý hiếm và các loài quan trọng khác thông qua các hoạt động bảo tồn, giám sát, cứu hộ và phát triển sinh vật; đồng thời kiểm soát được sự xâm lấn của các sinh vật ngoại lai xâm hại.
Tạo được sự kết nối với Vườn Quốc gia Cát Tiên để tạo hành lang đa dạng sinh học đủ lớn bảo đảm cho các loài động vật, đặc biệt là loài voi châu Á có một sinh cảnh phù hợp cho tồn tại và phát triển.
Thí điểm được mô hình bảo tồn voi và tránh xung đột giữa người với voi nhằm bảo vệ, phát triển quần thể voi hoang dã đang sinh sống trên địa bàn tỉnh Đồng Nai; hạn chế thiệt hại về tài nguyên đa dạng sinh học và giảm thiểu các nguy cơ gây ảnh hưởng đến tính mạng, sức khỏe, tài sản của người dân đang sinh sống, canh tác trong và khu vực giáp ranh lâm phần Khu Bảo tồn quản lý.
Thúc đẩy nhanh hơn quá trình phục hồi rừng cho 2.000ha rừng tự nhiên thông qua hoạt động nuôi dưỡng rừng, góp phần nâng cao chất lượng rừng, góp phần giảm phát thải khí nhà kính và nâng cao trữ lượng carbon rừng, hỗ trợ đạt được mục tiêu của chương trình hành động quốc gia về giảm thiểu biến đổi khí hậu và các mục tiêu có liên quan khác.
Về mặt xã hội, mục tiêu đề ra là thu hút, tạo việc làm cho hơn 10 nghìn lao động địa phương sống trong và giáp ranh Khu Bảo tồn tham gia vào các hoạt động bảo vệ rừng, bảo tồn đa dạng sinh học, phát triển du lịch sinh thái, góp phần ổn định cuộc sống.
Theo quyết định của Ủy ban nhân dân tỉnh Đồng Nai, kế hoạch sử dụng đất đến năm 2030 là hơn 99.400ha, giảm hơn 1.080ha so với hiện trạng năm 2020, trong đó đất rừng đặc dụng hơn 63 nghìn ha, giảm hơn 126ha so với quy hoạch năm 2020.
Phân khu bảo vệ nghiêm ngặt là hơn 11.500ha; phân khu phục hồi sinh thái hơn 46.200ha. Vùng nước nội địa hồ Trị An là hơn 32.500ha.
Khu Bảo tồn thiên nhiên văn hóa Đồng Nai thành lập năm 2004 trực thuộc Ủy ban nhân dân tỉnh Đồng Nai, được giao quản lý với tổng diện tích hơn 100 nghìn ha và hơn 32.500ha diện tích mặt nước hồ Trị An.
Hơn 20 năm qua, diện tích rừng tự nhiên được giữ vững ổn định, với tỷ lệ che phủ rừng luôn duy trì hơn 85%, góp phần điều hòa khí hậu, bảo vệ nguồn nước hồ Trị An và môi trường sinh thái của toàn vùng Đông Nam Bộ.
Khu Bảo tồn là nơi được đánh giá cao về đa dạng sinh học. Nơi đây đã ghi nhận được hơn 1.500 loài thực vật, hơn 2.000 loài động vật, trong đó có nhiều loài động, thực vật nằm trong Sách đỏ Việt Nam và Danh lục đỏ IUCN.