Nơi đây trưng bày hơn 300 hình ảnh, tư liệu, sơ đồ, hiện vật có giá trị lịch sử, văn hóa liên quan đến hương liệu, thổ sản Hội An nói riêng và tỉnh Quảng Nam ngày trước nói chung.
Trong lịch sử, Hội An được biết đến là vùng đất có nhiều loại thổ sản, hương liệu quý. Những câu chuyện về quế, trầm hương, hồ tiêu, cau, chè, yến sào hay lá Lao được kể lại bằng các hiện vật, tư liệu quý được kỳ công sưu tầm, khiến khách tham quan cảm nhận rõ sự mộc mạc, gần gũi nhưng đầy khác biệt của vùng đất, con người nơi đây.
Bảo tàng tập trung trưng bày xoay quanh bốn chủ đề, từ “Tổng quan về thổ sản Hội An, Quảng Nam”, “Hội An - Điểm trung chuyển hương liệu, thổ sản xứ Quảng” đến “Giới thiệu về một số loại thổ sản đặc hữu, tiêu biểu của Hội An, Quảng Nam” và “Thổ sản Hội An, Quảng Nam - Nối tiếp và phát triển”. Tại không gian sáng tạo này, hiện vật khiến các thuyết minh viên tâm đắc nhất khi giới thiệu với du khách chính là chiếc bàn nghiền bằng đá đã có từ lâu đời. Đây là minh chứng thuyết phục cho sự xuất hiện từ rất sớm cùng quá trình phát triển, thích nghi của nhiều loại đặc sản, dược liệu quý trong vùng.
Bên cạnh các loại thổ sản nhắc đến ai cũng nhớ, câu chuyện về “chè” lại khiến du khách thích thú hơn bao giờ hết. Các hiện vật cùng tư liệu tại đây thể hiện rõ, trong các giai đoạn phát triển sôi động của Đô thị thương cảng Hội An ngày ấy, sản vật chè Quảng Nam đã được thu mua, tập kết và vận chuyển để cung ứng nhu cầu sử dụng của người dân địa phương, sau đó là xuất khẩu đi các nơi. Hình ảnh về xưởng sao chế chè De Robe, các hóa đơn mua bán chè của một số cửa hiệu ở phố Hội An, chè Quảng Nam trong hội chợ quốc tế cùng nhiều hiện vật khác đã chứng minh nơi đây là một trong những nguồn thổ sản tiêu biểu thời bấy giờ.
Bên cạnh hoạt động trưng bày thu hút sự quan tâm của đông đảo du khách trong nước và quốc tế, Bảo tàng Thổ sản Hội An còn thường xuyên tổ chức các chuyên đề giáo dục cộng đồng thông qua việc đưa học sinh, sinh viên, người dân đến nghe kể chuyện và thực hiện các workshop giới thiệu về đặc sản vùng miền.
