Từ sáng sớm 13/6, Jordan và Iraq đã quyết định đóng cửa không phận và tạm dừng mọi hoạt động bay như một biện pháp phòng ngừa trước tình hình căng thẳng leo thang trong khu vực. Giới chức Iran cũng tuyên bố đóng cửa không phận cho đến khi có thông báo mới.
Trước tình hình này, tại khu vực, Emirates, hãng hàng không lớn nhất Trung Đông, cho biết, đã hủy các chuyến bay đến và đi từ Iraq, Jordan, Liban và Iran sau khi Israel tiến hành các cuộc không kích. Một số chuyến bay dự kiến vào ngày 13/6 và một chuyến bay đến Tehran vào ngày 14/6 đã được báo hủy trên trang web của hãng hàng không.
Các sân bay của Các tiểu vương quốc Arab thống nhất (UAE) đã cảnh báo về sự gián đoạn chuyến bay cho đến hết ngày 13/6.
Qatar Airways, một trong những hãng hàng không lớn nhất Trung Đông, cũng thông báo "tạm thời hủy các chuyến bay đến Iran và Iraq do (tình hình) hiện tại trong khu vực". Hai chuyến bay đến Damascus (Syria) của hãng vào ngày 13/6 đã bị hủy.
Hãng hàng không quốc gia El Al của Israel cho biết họ đã đình chỉ các chuyến bay đến và đi từ Israel. Trong khi, một hãng hàng không khác của Israel, Israir cho biết họ đang sơ tán và di dời máy bay khỏi Sân bay Ben Gurion ở Tel Aviv.
Trên thế giới, hãng hàng không Đức Lufthansa cũng cho biết họ đã tạm dừng mọi chuyến bay đến và đi từ Tehran, đồng thời tránh không phận Iran, Iraq và Israel trong thời điểm hiện tại.
Hãng Aeroflot của Nga hủy các chuyến bay tới Iran, và thay đổi các tuyến bay khác ở Trung Đông sau các cuộc không kích của Israel vào Iran.
Dữ liệu theo dõi chuyến bay cho thấy các chuyến bay liên tục chuyển hướng qua Trung Á hoặc Saudi Arabia. Một số chuyến bay dự kiến hạ cánh tại Dubai đã được chuyển hướng vào sáng sớm 13/6 theo giờ địa phương. Một chuyến bay của Emirates từ Manchester (Anh) đến Dubai (UAE) đã được chuyển hướng đến Istanbul (Thổ Nhĩ Kỳ).
Một chuyến bay của flydubai từ Belgrade đã chuyển hướng đến Yerevan (Armenia). Hãng hàng không giá rẻ này cho biết họ đã đình chỉ các chuyến bay đến Amman (Jordan), Beirut (Liban), Damascus (Syria), Iran và Israel và một số chuyến bay khác đã bị hủy, chuyển hướng hoặc quay trở lại sân bay khởi hành của họ.
Air India, với các chuyến bay châu Âu và Bắc Mỹ qua không phận Iran, cho biết một số chuyến bay đã bị chuyển hướng hoặc quay trở lại điểm xuất phát.
Miền đông Iraq gần biên giới với Iran là một trong những hành lang hàng không đông đúc nhất thế giới, với hàng chục chuyến bay qua lại giữa châu Âu và Vùng Vịnh, giữa châu Á đến châu Âu mỗi giờ. Theo dữ liệu của Eurocontrol, năm 2024, mỗi ngày không phận Trung Đông ghi nhận 1.400 chuyến bay đi và đến từ châu Âu.
Xung đột giữa Israel và Palestine ở Trung Đông kể từ tháng 10/2023 đã làm dấy lên lo ngại về an toàn khi các hãng hàng không thương mại phải chia sẻ bầu trời với các thiết bị bay không người lái và tên lửa. Việc các khu vực xung đột gia tăng trên khắp thế giới cũng đang trở thành gánh nặng ngày càng tăng đối với hoạt động và lợi nhuận của hãng hàng không.
