Giai đoạn 2020-2025, Viện Hải dương học đã triển khai tổng số 123 đề tài, nhiệm vụ khoa học, công nghệ ở các quy mô; trong đó, có 17 đề tài cấp Nhà nước, 2 đề tài thuộc Chương trình khoa học và công nghệ cấp quốc gia. Bên cạnh những nghiên cứu ứng dụng, Viện còn quản lý, điều hành Bảo tàng Hải dương học, nơi lưu giữ, bảo tồn và trưng bày các mẫu vật biển, góp phần truyền bá kiến thức về biển, phổ biến những thành quả của ngành hải dương học, giới thiệu tiềm năng nguồn lợi và cách sử dụng hợp lý tài nguyên biển.